一、歷史沿革

三軍總醫院成立於民國五十六年七月一日，在二ＯＯＯ年邁入新的里程碑，內湖國醫中心佔 地面積四十一公頃。在不中斷醫療服務的前提下，自八月二十九日開始搬遷作業，內湖院區於十月十一日開始門診及住院，急診作業則至十一月七日開始服務，未來病床數由一千五百餘床增加至一千八百五十床，並計畫設置中醫部門，而原汀州院區將轉型為護理之家，並保留門診和急診，本院整建後不僅建築及設備全面更新，並經組識與流程再造及醫院管理全面資訊化，以提升醫療服務效率與品質。

本院為國防醫學院之教學醫院，負有臨床醫療、教學與研究之責，醫療服務對象為軍人、健保以及一般民眾，診療科別計有內科等四十五科，為衛生署評定之醫學中心級醫院。

本院向來極重視醫療品質，追求卓越品質以達成本院願景－「品質的三軍總醫院」，為本院中、長程發展目標，期能藉由持續性的品質教育及分階段實施各專科品質管理，包括臨床路徑、作業流程標準化、方針管理、流程改善與管理、品質機能展開等進而步入全面品質管理，以提供質優、效率高、顧客滿意的服務。

二、組織架構

[ 醫療單位 ]
● 外科部
一般外科、小兒外科、大腸直腸外科、整形外科、泌尿外科、胸腔外科、心臟血管外科、實驗外科
● 內科部
胸腔內科、腸胃科、心臟內科、傳染及熱帶病科、風濕免疫科、腎臟內科、新陳代謝科、血液科、腫瘤科
● 家庭醫學部
● 社區醫學部
● 航太醫學部
● 小兒科部
一般兒科、新生兒科、小兒心臟科、小兒感染科、小兒神經科、小兒遺傳科、小兒腸胃科、小兒腎臟科、小兒內分泌及新陳代謝科、小兒血液腫瘤科、小兒免疫及過敏科、兒童重症醫學科、兒童急診醫學科、急救加護醫學科、兒童及青少年心理衛生科
● 神經內科部
● 神經外科部
● 婦產部
產科、生殖內分泌科、婦瘤部、家庭計畫科、一般婦科
● 骨科部
一般骨科、創傷外科、運動醫學科
● 高壓氧醫學部
● 中醫部
● 皮膚科部
一般皮膚
● 耳鼻喉科
顯微外科、聽覺功能科及鼻咽喉病
● 眼科
● 精神醫學
● 牙科
口腔診斷科、口腔顎面外科、牙體復形及根管治療、口腔膺復科、牙周病科、兒童暨齒顎矯正
● 臨床藥學
調劑科、臨床藥學
● 病理部
外科病理科、一般病理科、實驗病理科、臨床病理科
● 放射診斷部
一般放射診斷科、精神放射診斷科、超音波診斷科、心肺血管診斷科
● 放射腫瘤部
放射治療科，放射物理科
● 核子醫學部]
核子醫學科、核子製藥科
● 復健醫學部
● 麻醉醫學部
● 護理部

[ 行政單位 ]
● 企劃管理室　● 民診處　● 社會服務科　● 主計室　　● 人事室
● 總務室　● 教學室　● 臨床醫學研究部　● 醫勤室　● 病歷室
● 營養部　● 資訊管理室　● 能源設施室